造成靛蓝返染的原因主要有
（1）处理时间越长靛蓝的返染程度越大，但超过20min之后，靛蓝的返染变化不明显随着温度的升高靛蓝返染程度先升高后降低；
（2）织物上吸附的酶蛋白是造成靛蓝返染的主要原因，而且返染程度随着纤维素酶浓度的增加先升高后降低。游离的纤维素酶和靛蓝染料之间有两种作用力，即聚集作用和吸附作用；
（3）非离子表面活性TX-10和AEO-9能减轻靛蓝的返染；阴离子表面活性剂SDs由于它是特别有效的酶变性剂，可改变纤维素酶的结构，降低酶与靛蓝染料的亲和力，从而降低了靛蓝的返染；而阳离子表面活性剂8200的存在则提高了靛蓝染料的返染程度。
